Il définit la politique générale de la Fondation, son budget global. Il décide des opérations "phares". Il sélectionne les soutiens aux projets importants et aux chercheurs.
Il est composé :
de 11 membres fondateurs
Chacune des Caisses Régionales de Groupama est membre fondateur de la Fondation d'entreprise Groupama pour la Santé, ainsi qu'un représentant du personnel désigné par le Comité d'entreprise.
Chaque Caisse régionale est représentée par son Président.
de 6 personnalités qualifiées
Le Conseil d'administration est également composé de six personnalités qualifiées dans le domaine de la santé.
Elles sont chargées d'apporter leurs compétences professionnelles dans les choix de la Fondation Groupama pour la Santé.